欧盟全新数字化出入境系统（EES）于2025年10月启用，四个月内处理1700万旅客，标记四千余名逾期滞留者，1.6万人被拒入境。系统通过生物识别自动追踪90/180天停留规则，影响英国、美国等免签旅客。计划于2026年4月10日全面覆盖，届时停用护照盖章。逾期滞留可能面临罚款（如法国198欧元）或入境禁令，并与欧盟签证暂停机制挂钩，投资入籍国家面临更严监管。
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相关数据为欧盟新版签证暂停机制提供依据，该机制下调了可触发免签资格取消的逾期滞留阈值。
欧盟委员会公布的数据显示，欧洲全新数字化边境系统在运行的前四个月内，已标记出四千余名在申根区逾期滞留的旅客。
这套于2025年10月12日启用的出入境系统（EES），以生物识别追踪取代了传统的人工护照盖章，对所有非欧盟访客的出入境记录进行全程监管。
欧盟官员Henrik Nielsen在2月23日向欧洲议会公民自由委员会作简报时披露了上述逾期滞留人数。他表示，该系统已处理约1,700万名旅客，记录了3,000万次边境通行。
同期约有1.6万名旅客被拒绝入境，其中四分之一的拒签原因与违反申根区90/180天停留规则的逾期滞留人员有关。
出入境系统通过采集指纹、面部扫描等生物信息，追踪非欧盟公民进出申根区的时间，并自动计算停留时长，严格执行每180天内最多停留90天的规定。
该新规影响包括英国、美国公民在内的广大免签旅客。在该系统启用前，对90/180天停留限制的监管依赖边检人员人工核查护照印章，欧盟委员会称这一方式难以有效识别逾期滞留者。
负责该系统信息技术基础设施的欧盟机构EU-LISA执行董事Tillmann Keber表示，系统核心层面部署稳定且已全面投入运行。
系统部署分阶段推进。初期边境部门仅对约10%的符合条件旅客完成登记，2026年1月9日起该比例提升至至少35%，3月10日起达到50%，计划于4月10日实现全面覆盖，届时短期旅客将彻底停用护照盖章。
实际落地执行问题频发。巴黎戴高乐机场因自助设备故障、软件漏洞及人员配置不足出现通关延误；里斯本机场在生物识别检查引发严重拥堵后，一度恢复人工盖章。
机场运营方警告，启用该系统的区域，边境通关时长最多可能增加70%，有记录显示高峰时段等候时间长达3小时。
出入境系统的数据意义远超个体监管层面。2025年12月生效的欧盟修订版签证暂停机制，将可暂停某国申根区免签资格的逾期滞留增幅阈值从50%下调至30%。
在该系统启用前，难以精准统计逾期滞留率，缺乏按国家分类的数字化数据。
这套处理着1,700万旅客并自动标记逾期滞留人员的系统，彻底改变了这一局面。布鲁塞尔方面如今掌握着实时、基于生物识别的数据，能够了解哪些国籍的人员存在逾期滞留、滞留频率以及滞留时长。
修订后的机制还将投资入籍计划列为签证暂停的独立依据。欧盟委员会最新签证暂停机制报告进一步指出，运营投资入籍计划"本身"即可构成暂停免签资格的理由。
五个运营投资入籍计划的东加勒比国家（安提瓜和巴布达、多米尼克、格林纳达、圣基茨和尼维斯、圣卢西亚）面临最直接的影响。
2026年3月，格鲁吉亚成为首个被新版机制针对的国家，欧盟委员会暂停了格鲁吉亚外交、公务及官员护照持有人的免签待遇。该举措核心原因是民主与人权问题，而非逾期滞留，但也印证了新监管权限已正式落地。
对投资入籍司法管辖区而言，出入境系统是日趋完善的综合监管体系中的一环。计划于2026年底推出、2027年10月起强制实施的欧洲旅行信息与授权系统（ETIAS），将对免签旅客增加出行前筛查环节。出入境系统追踪在申根区内的人员，而欧洲旅行信息与授权系统则将管控入境资格。
《投资移民知情者》的一项高管调研显示，三分之一的投资移民行业高管认为，该系统将成为歧视投资入籍护照持有人的工具。市场担忧欧盟当局可通过算法筛查，在形式上保留免签待遇的同时，对投资入籍护照实施事实上的限制。
加勒比投资入籍国家已于2024年推行地区性全面改革，包括强制面试、强化背景调查及设立统一监管机构。这些改革能否满足布鲁塞尔方面的要求仍未可知，欧盟委员会的态度已从敦促改革转向考虑取缔相关项目。
被查获的逾期滞留旅客将面临各类处罚，包括罚款（法国为198欧元）、留下不良记录影响后续签证申请等。情节严重者可能被下达遣返令或临时入境禁令，不过在系统初期执行中此类措施较为少见，因重大疾病等不可预见情况导致的逾期可获豁免。
持有长期签证或居留许可的非欧盟公民无需在该系统登记，但在系统全面推行期间，仍可能在申根边境遭遇更长的排队等候时间。
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